叛军扫荡是少年三国志中获取资源的重要玩法，玩家等级达到35级后即可开启。每次攻打叛军需要消耗1个征讨令，若选择消耗2个征讨令可获得2.5倍攻击效果。征讨令上限为10个，每小时恢复1个，因此合理规划使用时间尤为关键。每日13:00-13:30为全力一击时段，消耗征讨令减半；19:00-19:30则为功勋翻倍时段，优先在此阶段集中攻打可最大化收益。叛军被击杀后，发现者和最后一击者可额外获得元宝奖励，需在首页领奖中心手动领取。
极限培养单核武将比均衡发展更适合叛军玩法，例如魏国曹操、蜀国关羽、吴国周瑜等核心武将应优先分配资源。红色装备和宝物精炼需集中供给主将，精炼等级建议至少达到45阶。突破等级高的武将在叛军中有额外加成，觉醒等级也需优先提升至5星。需注意项羽名将和虞姬在叛军战中无实际作用，上阵前需更换。阵营残暴属性可继承给名将，因此高暴击红将搭配对应阵营武将能显著提升伤害。
叛军BOSS战有特殊机制需针对性调整。战斗为自动进行，武将按编号顺序出手，1号位武将可在第四回合行动一次，因此主力输出应放置于此。叛军无防御属性，副将同样能造成伤害，但需将治疗武将的装备转移给群攻型副将以提升整体输出。叛军BOSS在第四回合会释放乱披风秒杀技能，因此前3回合需尽可能打出高爆发。张角流阵容对叛军BOSS有显著克制效果，可优先考虑组建。
资源分配与活动规划需遵循长期策略。叛军奖励随等级提升而增加，刻意卡级会损失高阶资源。每日功勋排行榜和单次伤害排行榜前200名可获得战功，用于商店兑换突破石等稀缺物资。叛军扫荡产出的天命石、将魂等资源应优先用于主将培养。每周三、五8:00-20:00开放的叛军BOSS活动需预留征讨令参与，跨服排名奖励包含金龙宝宝等珍贵道具。
