一之岛、二之岛和三之岛是玩家通关后可以探索的重要区域，这些岛屿隐藏着多种稀有神兽。一之岛主要分布有火焰鸟和急冻鸟，二之岛可捕捉闪电鸟，而三之岛则涉及超梦的剧情线索。这些神兽的捕捉方式各有不同，需要玩家具备特定的技能和策略才能顺利收服。
一之岛的火焰鸟位于火焰山深处，玩家需先击败两名火箭队成员，进入山洞后在最深处遭遇。急冻鸟则需前往双子岛，利用冲浪和推石技巧堵住瀑布水流，最终在最底层触发战斗。二之岛的闪电鸟出现在无人发电厂，玩家需通过特定路径进入，并确保队伍中有足够强力的电系或地面系宝可梦应对。
三之岛的核心剧情围绕超梦展开，玩家需完成七岛任务链后前往华蓝洞窟。洞窟内部结构复杂，需使用闪光技能照明，并破解迷宫路径才能抵达最深处。超梦的战斗力极强，建议携带具备高防御或克制超能力的宝可梦，同时准备充足的高级球和状态异常道具以提高捕捉成功率。
除主线神兽外，部分岛屿还隐藏着如洛奇亚、凤王等传说宝可梦的线索，但需通过特殊事件或道具触发。在完成特定任务后，玩家可乘船前往更遥远的岛屿，利用寻宝机器探索隐藏区域。这些神兽的捕捉条件更为苛刻，往往需要反复尝试或调整队伍配置。
火红三个岛的神兽捕捉是游戏后期的重要挑战，玩家需结合地图探索、技能运用和战斗策略才能顺利完成。建议提前规划队伍搭配，并善用存档功能以应对突发情况。
